《海上晨鐘》的故事由兩條線索展開: 一條是新誼的成長發(fā)展。一批民族資本家懷著實業(yè)報國的夢想,收購新誼制藥全部股份,新誼成為中國民族全資企業(yè),并迅速發(fā)展壯大。期間,在中共地下黨組織的領導下,新誼多次向蘇北新四軍輸送抗菌素等急需要藥品;太平洋戰(zhàn)爭爆發(fā)后,新誼為索回被日軍扣押物資,與其斗智斗勇;抗戰(zhàn)勝利后,圍繞爭奪德鄰公寓物權,暴露出國民黨官員的極度貪腐;上海解放前夕,對提藍橋監(jiān)獄關押的共產黨人開展生死營救;并發(fā)動工人開展護廠、迎接解放進行殊死搏斗,最終新誼在戰(zhàn)斗中發(fā)展壯大,王銘珊等也在復雜的斗爭中成長為紅色資本家,為新中國制藥工業(yè)的發(fā)展作出了杰出貢獻。 另一條線索是,“我”在追尋新誼歷史過程中,正值國企處于改革轉型時期,圍繞誰是企業(yè)的主人、企業(yè)改革中工人的利益置于何種地位等核心問題進行了思考和求索。一系列歷史與現(xiàn)實的碰撞,讓“我”對工作、生活、信仰,以及自己工作單位和工作性質有了新的認識。