藥物生物信息學(xué)

章　生物信息學(xué)概述
　節(jié)　生物信息學(xué)及其發(fā)展
　第二節(jié)　生物信息學(xué)的研究領(lǐng)域
　第三節(jié)　生物信息學(xué)在藥學(xué)領(lǐng)域的應(yīng)用
　參考文獻(xiàn)
第二章　計算機(jī)網(wǎng)絡(luò)基礎(chǔ)
　節(jié)　Internet簡介
　第二節(jié)　Internet提供的服務(wù)
　第三節(jié)　搜索引擎及其使用
　參考文獻(xiàn)
第三章　核酸序列及基因組數(shù)據(jù)庫
　節(jié)　核酸序列數(shù)據(jù)庫
　第二節(jié)　基因組與功能基因組數(shù)據(jù)庫
　參考文獻(xiàn)
第四章　蛋白質(zhì)序列及結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)庫
　節(jié)　蛋白質(zhì)序列數(shù)據(jù)庫
　第二節(jié)　蛋白質(zhì)序列復(fù)合數(shù)據(jù)庫
　第三節(jié)　蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)庫
　第四節(jié)　蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)分類數(shù)據(jù)庫
　參考文獻(xiàn)
第五章　生物醫(yī)學(xué)信息檢索
　節(jié)　集成式數(shù)據(jù)庫檢索系統(tǒng)
　第二節(jié)　生物醫(yī)藥文獻(xiàn)資源
　參考文獻(xiàn)
第六章　序列比對方法和相似性搜索
　節(jié)　概述
　第二節(jié)　雙重序列比對
　第三節(jié)　多序列比對
　第四節(jié)　點陣作圖法
　第五節(jié)　序列比對的統(tǒng)計學(xué)顯著性
　第六節(jié)　數(shù)據(jù)庫中的相似性搜索
　參考文獻(xiàn)
第七章　核酸序列分析
　節(jié)　基因結(jié)構(gòu)分析
　第二節(jié)　核酸序列組裝和基因定位分析
　第三節(jié)　新基因的發(fā)現(xiàn)及功能預(yù)測
　參考文獻(xiàn)
第八章　蛋白質(zhì)序列分析
　節(jié)　蛋白質(zhì)組成及基本性質(zhì)
　第二節(jié)　蛋白質(zhì)二級結(jié)構(gòu)預(yù)測
　第三節(jié)　特殊結(jié)構(gòu)或結(jié)構(gòu)特征分析
　第四節(jié)　蛋白質(zhì)三級結(jié)構(gòu)預(yù)測
　參考文獻(xiàn)
第九章　新藥開發(fā)中的生物信息學(xué)軟件
　節(jié)　概述
　第二節(jié)　PCR引物設(shè)計及其軟件介紹
　第三節(jié)　DNA序列分析軟件
　第四節(jié)　蛋白質(zhì)列分析軟件
　第五節(jié)　序列比對軟件
　第六節(jié)　RNA結(jié)構(gòu)預(yù)測及其軟件介紹
　第七節(jié)　生物信息軟件的工業(yè)標(biāo)準(zhǔn)GCG簡介
　第八節(jié)　生物分子與建模軟件InsightⅡ
　參考文獻(xiàn)
第十章　計算機(jī)輔助藥物設(shè)計
　節(jié)　生物信息學(xué)與藥物設(shè)計
　第二節(jié)　先導(dǎo)化合物的計算機(jī)輔助設(shè)計
　第三節(jié)　先導(dǎo)化合物的計算機(jī)輔助優(yōu)化
　第四節(jié)　新型多肽及蛋白質(zhì)分子設(shè)計
　參考文獻(xiàn)
第十一章　計算機(jī)輔助疫苗設(shè)計
　節(jié)　免疫學(xué)基本概念
　第二節(jié)　免疫應(yīng)答
　第三節(jié)　抗原表位預(yù)測方法
　第四節(jié)　計算機(jī)輔助疫苗設(shè)計相關(guān)軟件及應(yīng)用
　參考文獻(xiàn)
第十二章　生物芯片技術(shù)
　節(jié)　基因芯片
　第二節(jié)　蛋白質(zhì)芯片
　第三節(jié)　生物芯片技術(shù)在新藥研究中的應(yīng)用
　第四節(jié)　生物芯片與生物信息學(xué)
　參考文獻(xiàn)
第十三章　藥物基因組學(xué)
　節(jié)　藥物基因組學(xué)的發(fā)展
　第二節(jié)　藥物基因組學(xué)的研究內(nèi)容和方法
　第三節(jié)　藥物基因組學(xué)的應(yīng)用前景
　參考文獻(xiàn)
附1　生物信息學(xué)大事記
附2　FASTA和BLAST搜索參考
附3　生物信息學(xué)常用數(shù)據(jù)庫