RNA干擾（原理與應用）

序言
前言
第1部分 RNA干擾理論
1 RNA干擾的發(fā)展歷史與意義
1.1 RNAi的發(fā)現(xiàn)
1.2 RNAi的意義
2 微小RNA概述
2.1 miRNA的發(fā)現(xiàn)過程
2.2 miRNA的生物學特征
2.3 miRNA的基因組學
2.4 miRNA的成熟及效應過程
2.5 miRNA的功能
2.6展望
3 依賴于RNA的RNA聚合酶
3.1.RdRP在基因沉默中作用的發(fā)現(xiàn)及相關證據(jù)
3.2 RdRP的生化物理性質及其晶體結構
3.3 RdRP與RNA病毒
3.4 RdRP和RNA沉默
3.5降級性PCR、過渡性RNAi及系統(tǒng)性RNAi
3.6 RdRP作用過程中的問題
4 微處理器
4.1微處理器的相關蛋白成分及其對miRNA的加工
4.2 pre—miRNA從細胞核輸出的過程
5 干擾性小RNA產生的關鍵性蛋白——Dicer
5.1DCR的發(fā)現(xiàn)背景
5.2DCR的一般生化屬性及相關生物學功能
5.3DCR的作用方式及在不同生物體中的作用
5.4DCR作用的底物——dsRNA及pre—miRNA的特征及來源
5.5DCR的加工產物——siRNA和miRNA
5.6不同生物體中DCR的同源物及其基因
6 RNA誘導的沉默復合體
6.1RISC的發(fā)現(xiàn)背景
6.2參與RISC組裝的小RNA分子及其可能的組裝模式
6.3RISC的主要成分——AGO蛋白
6.4R[SC在果蠅體內的組裝模型
6.5RNAi的剪切模型
6.6RISC指導的靶向性剪切的動力學研究
6.7參與RISC組裝及效應過程的相關蛋白質及影響因子
6.8 RISC的功能
6.9小結與展望
7 細胞核內的RNA干擾途徑
7.1RNA指導的DNA甲基化
7.2RNAi和異染色質的形成
7.3RNAi和DNA切除
7.4減數(shù)分裂I生沉默、配對和RNAi
7.5細胞核內RNAi途徑的作用方式
7.6其他生物體中的相關機制
7.7小結與展望
第2部分 RNA干擾技術原理與方法
8 siRNA或dsRNA的設計與篩選策略
8.1重組質粒方法篩選siRNA
8.2高通量篩選siRNA的微陣列方法
9化學方法合成siRNA
9.1 2’一tBDMS方法
9.2 2’一TOM方法
9.3 2’一ACE方法
10 siRNA的體外轉錄及生物合成方法
10.1PCR siRNA合成法
10.2T7 RNA聚合酶轉錄法
10.3應用重組人Dicer體外合成siRNA
11 基因工程方法制備siRNA
11.1表達元件的構建
11.2載體構建
12 siRNA的實驗技術方法
12.1siRNA的體外合成及轉染方法
12.2體外轉錄制備dsRNA
12.3基因工程方法制備siRNA及轉染細胞的方法
12.4 RNAi在其他生物體中的應用研究方法
13 miRNA的實驗技術方法
13.1miRNA的提取
13.2miRNA克隆
13.3miRNA分子雜交檢測技術——Norlthern印跡
第3部分 RNA干擾的應用研究
14 RNA干擾在研究基因組功能方面的應用
14.1動植物中的RNAi
14.2 RNAi在線蟲全基因組功能研究中的應用
14.3 RNAi在果蠅研究方面的應用
14.4 RNAi技術在錐蟲研究中的應用
14.5 PTGS在植物基因及基因組功能方面的研究
15.RNA干擾在研究胚胎發(fā)育方面的應用
15.1 RNAi在小鼠卵母細胞和胚胎中的應用
15.2 RNAi在鳥類胚胎發(fā)育中的研究
16 RNA干擾在抗病毒研究中的應用
16.1 RNAi抗HIV_1病毒感染
16.2 RNAi抗禽類逆轉錄病毒感染
16.3 RNAi抗肝炎病毒感染
16.4 RNAi抗流感病毒感染
16.5 RNAi抗SARS相關冠狀病毒感染
16.6 RNAi抗輪狀病毒感染
17 RNA干擾在腫瘤研究中的應用
17.1 目前常用的腫瘤相關基因功能的研究方法
17.2 RNA在腫瘤生物學中的應用
17.3 RNAi在基因治療中遇到的主要問題
18 RNA干擾在其他領域的治療研究
18.1 RNAi在心血管疾病中的應用研究、
18.2 RNAi在神經系統(tǒng)疾病中的應用研究
18.3 RNAi在內分泌系統(tǒng)疾病中的研究進展
18.4 RN～在自身免疫性疾病中的應用研究
18.5 RNAi在生物學和醫(yī)學中的應用前景
索引